素粒子の種類を物理量と考えると？

物理量は、エルミート演算子で表され、その固有値が、射影測定した場合の測定値です。
で、素粒子の種類の観測は、限りなく誤差のない測定と見做せますから、理論的には射影測定です。
したがって、素粒子の種類も、物理量であるならエルミート演算子で表される
としてよいと思います（素粒子自体のことではないです）

フェルミオンは、
ν_e , e,、、、 νmu ,μ、、、 νtau ,τ、、、の3行4列であり、当然ながら正方行列ではない
のでエルミート演算子では、表せません。
でも、4ｘ4のエルミート行列を考えると、フェルミオンは２種類がペアになりますから
これを、「対角要素について」複素共役とすれば、

１、νe、νmu、νtau
ｅ、 １、　d、　S
μ、 u、 １、　b
τ、 c、 t、 　１

で　４行4列に綺麗に並びます。
これを、１行づつ上へ掛けていくと、（異なる要素は直交と仮定）

e、 νe、0、0　
0、 u、 d、　0　
0、 0、 t、　b　
τ、0、 0、νtau　

となり、eとνe、ｕとｄ等、ペアになっています。
でも、これでは、ｃとSの組み合わせが消えます。
なので、掛けていくのを　すべての組み合わせとすると、
上記に加えて、
μ, 0, νmu, 0　
0, c, 0, S　　
もちゃんと出てきます。